人工合成虾青素含量以顺式结构为主，并且在人体内不能转化成天然的反式构型。合成虾青素的生物吸收效果也较天然虾青素差，并且其在体内不能转化为天然构型，其着色能力和生物效价均比同浓度的天然虾青素低。
利用化学手段合成虾青素时将不可避免的引入杂质及化学物质，如非天然副产物等，将降低其生物利用的安全性。
美国FDA已禁止化学合成的虾青素进入保健食品市场。
因此，红球藻天然虾青素的营养应用、生物活性及保健作用无可替代。
