螺旋藻的营养价值在于其蛋白质含量高，可消化系数高和吸收利用率高。到目前为止，世界上还没有一种可食生物，其蛋白质含量和质量能超越螺旋藻的水平。螺旋藻的蛋白质含量高达68% ~ 72%，且螺旋藻蛋白质是水溶性的，又具有动物性蛋白的一切优点，动物性蛋白的特点体现在:是纯度高， 二是与脂类结合，极易被人体消化吸收和利用，效价高，安全。螺旋藻还与其他微藻生物不一样，其细胞膜由类脂多糖组成，几乎不含有纤维素，因此，螺旋藻被人体摄入后，它包含的营养物，绝大部分可以被人体迅速地消化和吸收。

据研究人员的消化试验测定，螺旋藻的可消化性系数(DC)为83% -95%，即人体摄食后在消化道中18小时内，83%以上的藻体蛋白质氨基酸与维生素类能被吸收并转运。蛋白质的真消化率(TD)达到75.5%，生物学值( BV.机体对蛋白质的转化利用率)可达68.0%，相当于乳酪的85% -92%。

螺旋藻能与常规禾谷类食物起到互补作用。人类的主食禾谷类食物的基本营养是淀粉类碳水化合物，在营养学上称为单营养( malnutrition)，其蛋白质含量低与氨基酸种类不全，是以往农村人口中发生营养偏缺的主要原因。而且，一般植物性蔬果类与禾谷类食物的蛋白质是醇溶性的，并且多与纤维素相结合，有的甚至还含有不易消化的单宁酸(对人体产生一定毒素)，所以，植物性蛋白并不适合于哺乳动物的吸收与利用。显然，相比螺旋藻而言，禾谷类的蛋白质及其氨基酸的质量与有效利用率要逊色得多。

螺旋藻的蛋白质与人体蛋白质非常接近，其中含有丰富而全面的赖氨酸、苏氨酸等人和动物的必需氨基酸，其氨基酸含量与世界卫生组织( WHO)推荐的成年人日摄入量基本一致;螺旋藻的蛋氨酸和胱氨酸等含硫氨基酸，虽然含量比WHO的推荐模式偏小一点，但比禾谷类、子实类和蔬菜类要高得多。

据联合国粮农组织(FAO)报告称，蛋白质营养不良仍然是发展中国家间的的挑战。自人类进入21世纪以来，在非洲和亚洲的绝大多数发展中国家，人们普遍仍以低蛋白质营养的禾谷类食物为主粮，其食物中严重缺乏赖氨酸和苏氨饭必需氨基酸类，蛋白质营养不良已对这些地区成年人和儿童的健康构成严重的成胁。为此，联合国粮农组织紧急呼吁，以高蛋白含量的螺旋藻作为这些地区的补充食品，可以有效地改善他们的营养状况，增强人们的体质与健康。

尽管螺旋藻的出现，使人们看到了健康生活的希望，但是人们目前面对的常规食物仍然是缺乏蛋白质的偏缺营养或单一营养( malnutrition)，这是传统农业面临的重大挑战。如何使天下人吃饱、吃好又吃出健康，也是向科学家提出的一个新课题。为此，当代生物科学家们计划采用分子育种技术，通过细胞质融合技术或转基因技术，把螺旋藻的蛋白质基因组或某种需要的优良性状，转移到普通粮食作物中去。或许不久的将来，人们也可以从普通食物中吃到转基因的螺旋藻的优质蛋白质。

高蛋白食物螺旋藻的另一特征是低脂肪、低热量，而且不含低密度胆固醇(LDL)，这对于现代人的健康计划无疑是一个重大贡献。首先，螺旋藻的脂肪含量低于其他蛋白质食物，其类脂物在藻体中所占比例不大(6.5%~7.8%)，但多属于w系列的多不饱和脂肪酸类;碳水化合物则以多糖类为主，其含量在16% ~ 20%。如果你吃了10克螺旋藻，在获得了6克优所蛋白质的同时，才不过摄食了1448焦耳的热能、1.3毫克的胆固醇:如果你吃了一个鸡蛋，获得的蛋白质也是6克，却同时摄食了335焦耳的热能、300毫克的胆固醇。这也是人们选择食用螺旋藻的一大好处。

螺旋藻是蛋白低脂肪低热量的食物（100克干藻中的含量）